組蛋白修飾是調控基因表達的重要表觀遺傳學機制,在保持胚胎干細胞的全能性以及*癥的病理過程中起到了重要的作用。不同的組蛋白修飾有可能組成復雜的“組蛋白編碼”。
近兩年來,高通量的染色體**沉淀結合全基因組DNA芯片或新一代短序列測序技術(“ChIP-chip”和“ChIP-seq”)產生了高清晰度的人類全基因組上的諸多組蛋白修飾位點。中科院韓敬東研究組在此基礎上,利用貝葉斯網絡推測組蛋白各種不同修飾和基因表達之間的因果關系及組合關系。該方法在PcG復合物和H3K27me3的數據上進行測試,所得結論和現有的實驗結果一致。組蛋白各種不同修飾和基因表達之間建立的貝葉斯網絡具有很好的交叉驗證結果。它不僅吻合很多已知的組蛋白與基因表達的關系(如H3K27me3抑制基因表達,H3K4me3促進基因表達,以及這兩種修飾的共同影響),而且發(fā)現了許多新的組蛋白修飾和基因表達之間的關系,以及組蛋白修飾相互之間形成的邏輯關系。
該工作為人們認識不同組蛋白修飾之間的復雜關系及其對基因表達的影響了一個新的視角,同時也為該領域了一種十分重要的研究方法,是破譯復雜的“組蛋白編碼”研究方面的重要進展。該結果已經發(fā)表在6月18日的《基因組研究》
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